蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在課題設(shè)計及基金申請的解決方案

蛋白質(zhì) 蛋白組學(xué) 技術(shù) 課題設(shè)計基金申請解決方案解決方案

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發(fā)布時間：2016-11-03

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2017年1月7-8日（上海）
蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在課題設(shè)計及基金申請的解決方案學(xué)習(xí)班
邀請函

課程背景
目前，高通量的基因組、轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)非常成熟，能大規(guī)模的對樣品DNA和RNA進(jìn)行分析，篩選到成千上萬的差異表達(dá)基因。但是有一個核心的問題，即DNA/RNA的水平與蛋白質(zhì)的水平?jīng)]有正相關(guān)性（＜30%），導(dǎo)致在基因?qū)用嫔虾Y選到差異表達(dá)基因往往不能映射到蛋白質(zhì)水平；此外，蛋白質(zhì)區(qū)別于DNA/RNA的另一個顯著特性—翻譯后修飾（磷酸化、乙?；⒓谆?、泛素化、SUMO化等），蛋白質(zhì)翻譯后修飾往往會影響/改變蛋白質(zhì)的活性和功能。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾顯然無法在DNA和mRNA水平上進(jìn)行檢測。
現(xiàn)在是后基因組時代。絕大多數(shù)的生物學(xué)/醫(yī)學(xué)的學(xué)術(shù)文章，都要求做到蛋白質(zhì)水平。鑒于DNA/RNA與蛋白質(zhì)的諸多差異，直接從蛋白質(zhì)水平入手，對樣品進(jìn)行分析是大勢所趨。LC-MS為基礎(chǔ)的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的快速發(fā)展，為蛋白質(zhì)的高通量分析和后續(xù)特定蛋白質(zhì)的深入功能解析提供了強(qiáng)有力的技術(shù)保障，其突出優(yōu)勢體現(xiàn)在：（1）高通量地對未知蛋白質(zhì)樣品進(jìn)行分析，能一次從樣品中鑒定到成千上萬種蛋白質(zhì)；（2）真正做到有的放矢。通過LC-MS分析，能一目了然地知曉樣品中的蛋白質(zhì)具體信息。此外，各種

課程背景
定量技術(shù)的引入（SILAC、iTRAQ、TMT、label-free、MRM等），不但能知道樣品中有什么蛋白質(zhì)，同時又能對多組樣品中的每一個蛋白質(zhì)的表達(dá)水平進(jìn)行相對/絕對的定量，有利于快速鎖定目標(biāo)分子，從而進(jìn)行深入的生物學(xué)功能分析；（3）能直接對各種翻譯后修飾進(jìn)行鑒定與定量分析。
通過LC-MS為基礎(chǔ)的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)，您可以進(jìn)行差異蛋白質(zhì)組學(xué)分析（篩選樣本中差異表達(dá)的蛋白質(zhì)）、相互作用分析（蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)、DNA、RNA、小分子等）和蛋白質(zhì)翻譯后修飾分析（甲基化、磷酸化、乙酰化等）等，能鑒定/定量成百上千個蛋白質(zhì)/位點(diǎn)，擁有了專屬于您的、樣品特異性的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫。問題：（1）在這么多的蛋白質(zhì)中，如果鎖定感興趣的目標(biāo)分子？（2）如何運(yùn)用傳統(tǒng)的生物學(xué)技術(shù)和方法對篩選到的目標(biāo)分子進(jìn)行細(xì)致的生物學(xué)功能分析，為文章添色，提高文章的檔次？
本課程將從LC-MS為基礎(chǔ)的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)原理出發(fā)，結(jié)合發(fā)表的學(xué)術(shù)文章，對目前的主流蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)進(jìn)行詳細(xì)講解，旨在幫助學(xué)員深入理解蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的原理、優(yōu)勢以及如何將蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)系統(tǒng)地整合到自己的課題設(shè)計和標(biāo)書申請項(xiàng)目中。

課程解決問題
什么是蛋白質(zhì)組和蛋白質(zhì)組學(xué)？
蛋白質(zhì)組學(xué)的研究內(nèi)容是什么？
LC-MS進(jìn)行蛋白質(zhì)鑒定的具體原理
1、LC的作用 2、MS數(shù)據(jù)采集
數(shù)據(jù)庫搜索（database search）如何完成蛋白質(zhì)的鑒定？
1、蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫資源及下載
2、MS數(shù)據(jù)搜庫及蛋白質(zhì)鑒定
2D-gel的技術(shù)原理
結(jié)合文獻(xiàn)，講解2D-gel結(jié)合MALDI-TOF MS進(jìn)行差異蛋白質(zhì)組學(xué)分析方案
1、樣品類型及實(shí)驗(yàn)設(shè)計
2、2D-gel分離及差異點(diǎn)篩選
3、差異點(diǎn)MALDI-TOF MS鑒定
4、差異蛋白質(zhì)驗(yàn)證及功能分析
結(jié)合文獻(xiàn)，講解免疫共沉淀（Co-IP）結(jié)合LC-MS進(jìn)行蛋白質(zhì)相互作用分析方案

課程解決問題
根據(jù)定量結(jié)果，篩選差異表達(dá)的蛋白質(zhì)
差異表達(dá)蛋白質(zhì)的功能分析
結(jié)合文獻(xiàn)，講解運(yùn)用SILAC技術(shù)（super-SILAC）對人體病理組織進(jìn)行差異比較定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析方案
Super-SILAC的技術(shù)原理
Super-SILAC實(shí)驗(yàn)設(shè)計
Super-SILAC結(jié)合LC-MS對蛋白質(zhì)樣品進(jìn)行鑒定與定量分析
iTRAQ/TMT技術(shù)原理
iTRAQ/TMT實(shí)驗(yàn)設(shè)計
結(jié)合文獻(xiàn)，講解運(yùn)用iTRAQ/TMT技術(shù)進(jìn)行差異蛋白質(zhì)組學(xué)分析方案
1、iTRAQ/TMT實(shí)驗(yàn)設(shè)計及流程
2、蛋白質(zhì)LC-MS鑒定與定量
3、定量數(shù)據(jù)分析，篩選差異表達(dá)蛋白
4、差異表達(dá)蛋白質(zhì)生物學(xué)方法（western blot、ELISA等）驗(yàn)證
5、差異表達(dá)蛋白質(zhì)功能解析
Label-free定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)原理
結(jié)合文獻(xiàn)，講解運(yùn)用label-free技術(shù)進(jìn)行差異蛋白質(zhì)組分析

課程解決問題
1、免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)設(shè)計
2、免疫沉淀蛋白質(zhì)復(fù)合物純化
3、差異條帶切割、酶解及LC-MS鑒定
4、蛋白質(zhì)功能注釋查詢及目標(biāo)分子篩選
5、目標(biāo)分子的生物學(xué)功能實(shí)驗(yàn)解析相互作用的分子機(jī)制
SILAC定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)原理
SILAC實(shí)驗(yàn)設(shè)計
結(jié)合文獻(xiàn)，講解SILAC結(jié)合LC-MS進(jìn)行細(xì)胞差異蛋白質(zhì)組學(xué)分析方案
1、實(shí)驗(yàn)設(shè)計及流程
2、蛋白質(zhì)LC-MS鑒定及定量分析
3、根據(jù)定量結(jié)果，篩選差異表達(dá)的蛋白質(zhì)（幾百個）
4、生物信息學(xué)（GO分類、pathway聚類等）分析差異表達(dá)的蛋白質(zhì)
5、生物學(xué)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)
結(jié)合文獻(xiàn)，講解SILAC結(jié)合免疫沉淀（Co-IP）和LC-MS進(jìn)行蛋白質(zhì)相互作用分析方案
1、SILAC+Co-IP實(shí)驗(yàn)設(shè)計
2、Co-IP純化蛋白質(zhì)復(fù)合物及SDS-PAGE分離
3、蛋白質(zhì)復(fù)合物L(fēng)C-MS鑒定與定量

注冊費(fèi)用：
2400元/人。授課期間發(fā)放紙質(zhì)邀請函（蓋章）和發(fā)票。
按交費(fèi)先后順序確定座位號。提供午餐，晚餐自理。
付款方式：
A：銀行轉(zhuǎn)賬
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